本题考查工程质量管理体系。

A.文件化的质量方针和质量目标是组织确定的质量方针和质量目标应文件化并体现在其他相关文件中，包括工程项目质量管理相关文件。  

B.程序文件是质量手册的支持性文件，是企业为落实质量管理工作而建立的各项管理标准和规章制度，是企业各部门为贯彻落实质量手册要求而制定的实施细则。 

C.质量计划是指对特定的客体（产品、服务、过程等），规定由谁及何时应用所确定的程序（程序通常涉及质量管理过程以及产品和服务实现过程）和相关资源的规范。 

D.质量手册是质量管理体系的规范（规范是阐明要求的文件），是阐明一个企业质量政策、质量体系和质量实践的文件，是在实施和保持质量体系过程中长期遵循的纲领性文件。 

故本题正确答案为D选项。