牙本质发育不全的组织学表现为：牙本质内小管数目减少，方向紊乱，许多小管形态不规则，管径增大，并存在无小管的牙本质区，故B、C不选。牙本质基质可呈颗粒状，并见小球间钙化，故D项正确。异常牙本质的过度形成导致髓室、根管部分或完全消失，故A不选。釉牙本质界呈直线而非波浪形，表面釉质易剥脱，E不选。