合规检查的主要目标是制度、程序和流程的执行情况。无论是基金公司的财务管理、公司治理结构，还是投资管理，这些检查的每项内容都有专门的法律法规及公司制度进行规范，合规检查主要看基金管理人业务部门是否落实了这些法律法规和公司制度。