病原体以病毒为主，可占原发上呼吸道感染的90%以上，支原体和细菌较少见，病毒感染后，上呼吸道黏膜失去抵抗力，细菌可乘虚而入，并发混合感染。上呼吸道感染的病原体90%以上为病毒，主要有鼻病毒、合胞病毒、副流感病毒、感冒病毒、柯萨奇病毒、埃可病毒