SLE临床表现多种多样，常呈多器官受累，常因早期表现不典型，容易误诊和漏诊。
（一）全身症状：发热、乏力、体重减轻等。
（二）皮肤与黏膜：80％有皮肤损害，典型为面部蝶形红斑；手掌大小鱼际、指端和指（趾）甲周可出现红斑；可有光过敏、脱发、雷诺现象；活动期有口腔溃疡。
（三）关节与肌肉：85％关节受累，常表现不对称的多关节痛，呈间歇性、红肿少见，X线片多数正常。40％有肌痛，少数出现肌炎。
（四）肾：几乎所有病人肾脏均有病理变化。临床有表现的约75％，可表现为急性肾炎、急进性肾炎、隐匿性肾小球肾炎、慢性肾炎和肾病综合征。早期可仅有尿检异常，而晚期发生尿毒症，是SLE死亡的常见原因。
（五）心血管系统：约30％有心血管表现，以心包炎最常见，约10％有心肌炎及周围血管病。
（六）肺：约35％有狼疮肺炎，偶有肺间质病变。
（七）神经系统：中枢神经系统以脑受累最常见，约10％有各种精神障碍，约l5％出现癫痫发作。中枢神经系统症状表示病情活动及危重，预后不良。少数发生偏瘫、蛛网膜下腔出血、脊髓炎、颅神经及周围神经病变。
（八）消化系统：约30％有消化系统症状，肝可以肿大，血清转氨酶升高。少数发生急腹症，表明SLE发作。
（九）血液系统：约30％有贫血，仅l0％为溶血性贫血，约40％有白细胞减少或淋巴细胞绝对数减少，约20％有血小板减少，可伴出血。部分可发生淋巴结和脾脏肿大。
（十）眼：约30％有眼底血管病变而影响视力，严重的可能致盲，及时治疗可逆转。继发干燥综合征时可有干燥性角结膜炎。